Consistenza: 1543 unità archivistiche
Estremi cronologici: 1086-1972
Strumenti di corredo: Inventari sommari del 1912 e 1953 (sulla base di un inventario analitico del 1894) sottoposti a revisione sistematica nel 1989 e revisione sommaria nel 2005.

L'archivio è composto da cinque fondi aggregati di cui quattro provenienti da istituzioni monastiche appartenenti ad uno stesso quadro storico-istituzionale ed uno diretto derivato, ma di epoca successiva. Nel 1786, in seguito alla soppressione degli Ordini religiosi, il monastero di S. Anna fu destinato dallo stesso Granduca Pietro Leopoldo a trasformarsi in un Conservatorio femminile e fu dotato di beni provenienti dai soppressi monasteri di S. Martino, S. Giuseppe e S. Elisabetta. Di questi beni facevano parte anche i rispettivi archivi che andarono ad aggiungersi a quello preesistente di S. Anna e al nascituro archivio del Conservatorio. Durante l'avvicendamento dei vari organi di governo che si sono succeduti alla direzione del Conservatorio, fino ad arrivare alla Scuola Superiore Sant'Anna di Studi Universitari e Perfezionamento, i fondi sono stati mantenuti in buono stato di conservazione e ordinamento grazie alla serie di interventi operati dalla fine del XIX secolo. Lo studio delle carte contenute nell'archivio delinea un tracciato storico che dalla vita economica e sociale di un monastero del XV secolo arriva fino alla ripresa economica del secondo dopoguerra vista attraverso i documenti di un convitto pubblico. Sono presenti piante e disegni di notevole interesse realizzati, tra i secoli XVI-XIX, da ingegneri e agrimensori.